¿En que principios te basaste para decir que habia cuello de botella? solo pregunto porque hay gente que no interpreta bien los datos del afterburner. Se piensa incorrectamente que por tener la grafica al 100% tienes cuello de botella, tampoco por tenerla a menos lo tienes. El cuello de botella lo marca más los frames y el porcentaje de la CPU, si esta la CPU al 100% y los frames no son altos, fluctuan mucho y vas por debajo de 60, con tirones, salvo juegos mal depurados, que hay muchos, es que tienes cuello de botella. Basicamente hay que fijarse más en la fluidez que en los números, si vas a gastar 500€ en una placa/micro/memoria por leer unos números, mientras que tu experiencia jugando ha sido buena, no es algo que fuera a tener mucho sentido.
Estas mezclando las churras con merinas de una manera impresionante. Voy a suponer que es porque te has explicado muy mal, y no porque no tienes ni idea.
Cuello de botella a la GPU se le hace cuando uno de los otros componentes no la deja rendir a su máxima capacidad o cerca de su máxima capacidad.
Hablando de cuello de botella causado por CPU. Puede ser constante o intermitente (por llamarlo de alguna forma).
El constante es cuando realmente el CPU no puede con la carga y te limita la gráfica en todo momento en los juegos más difíciles. Ejemplo r5 2600+ ram 2133+ gtx 1080ti. La gráfica te irá a 60-80%.
Luego el intermitente es cuando la gráfica está la gran mayoría de veces al 98-99%, pero hay momentos puntuales cuando baja de ese porcentaje. Este último es el que suele joder (no siempre, por ejemplo un 8700k 5ghz le hace cuello de botella en algunos momentos a una 1080ti en bf, pero sigues estando en la marca de los 150fps) más la experiencia de juego porque los saltos entre mínimos y máximos son muy grandes, y va a trompicones. Ejemplo: 7600k 5ghz+ ram 3200+1080ti. Tendrás 99% de uso la gran mayoría del tiempo, pero tendrás picos bajos en los 40%, dependiendo del juego. Esos en bf1, son bajones de 100fps. Verás que bonito es.
Todo eso, independientemente de que el CPU este al 100% o NO. El CPU no tiene porque estar al 100% para limitar la gráfica.
Luego está a consideración de cada uno, donde pone el límite para vivir con cuello de botella. Aquí el OP tiene el cuello de botella "intermitente" y es por falta de hilos. Que juega en un monitor de 144hz, la gráfica le saca 90 de media y el 1% baja en los 40?! eso es inaguantable!!! Que tiene un monitor de 60hz, pues que límite el fps al máximo de su monitor, y los bajones ya no afectaran tanto.