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Aunque parezca que con PCIe 3.0 x8 vaya a funcionar a la mitad de velocidad la gráfica, es totalmente incierto.
La gráfica de la comparación es una GTX 1080, la tuya es bastante más potente, pero vamos, desde mi opinión a partir (inclusive) de PCIe 3.0 x8 ya no hay ningún cuello de botella presente.