Los ventiladores necesitan espacio por delante de ellos, porque no se inventan el aire de la nada. Y una GPU convencional de 2 o 3 ventiladores, saca el aire por los laterales y al golpear en los laterales se divide, llendo para arriba y para abajo. Cuanto menos espacio tienes delante de los ventiladores de la GPU, más aire del que expulsa es reciclado. Uno de los factores más importantes a la hora de refrigerar una GPU así, ni es un radiador más grande, ni unos ventiladores con más RPM, sino literalmente ampliar el espacio que tiene la GPU para respirar, que el aire al que tiene acceso, sea lo más cerca de la temperatura ambiente y que el aire que suelta, vaya de la manera más facil fuera.
Entre 2 cajas de airflow, una más grande que la otra, el CPU te dará iguales o peores temperaturas en la grande, pero la GPU tendrá considerablemente más espacio para "respirar". Incluso cajas cerradas como las be quiet "silenciosas", por ejemplo la 801 que suelen dar 10-15ºC extra en CPU comparadas con una caja de airflow, son muy competitivas en temperaturas de GPU.
No solo eso, sino que tienes la tarjeta de sonido entre la GPU y la fuente, que son las 2 piezas por las cuales más electricidad pasa, aunque consigas aislar perfectamente la tarjeta de sonido, te limita en cuanto a que componentes puedes usar en ella, y es más cara de fabricar, por lo tanto una externa, acaba siendo más barata para la misma calidad o mejor para el mismo precio, y aunque no es una regla escrita en piedra, pasa muchas veces.