En mi placa base los cambie por los mas finos (0,5mm), ya que los disipadores van sujetos con tornillos y aun quitando los pads y colocando nuevamente los disipadores sin los pads, seguia haciendo presion al atornillar, asi que para este caso, cuanto mas fino el pad, mejor transferencia termica. Tienes que ver si los tuyos van atornillados o a presion, para el segundo caso deben de ser del mismo grosor que los que tenga la placa ahora. Deberias de comprobarlo por ti mismo.