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Estás mezclando cosas, como dice Orton, si enchufas un ("usb 3.0" (usb 3.1 gen 1 también llamado)) en un puerto 2.0, funcionará a la velocidad de usb 2.0
Pero lo último que pones, es la segunda variante de USB 3.1 (gen 2), que básicamente es el novedoso Tipo C; no tiene sentido a día de hoy que compres un pendrive (o cualquier otra cosa) tipo c, porque si lo haces, tendrás que poner ese adaptador en prácticamente todos los ordenadores donde quieras ponerlo.
USB 3.1 (gen 2) también posee el conector tradicional de USB, si no fuese así, sería un desastre en cuanto a ventas e implementación.
Por ejemplo tienes pendrives que tienen ambas conexiones (lo lógico), como el SanDisk Ultra Dual 256GB Type-C
Resumiendo puedes poner el usb que quieras menos el tipo C. Pero ojo las memorias usb baratos son todos muy lentas te ponga 2.0 o 3.0 si te interesa algo un poco mas rapido fijate en el rendimiento de lectura y escritura.