Debe ser por algún tema de actualizaciones del propio Discord, pero cada programa tiene sus propias estructuras. Si lo usas desde el menú de programas ¿carga bien?. Algo similar me pasaba frecuentemente con el grabador de pantalla. Al anclarlo al inicio, haciendo click en el menú contextual desde la barra de tareas cuando el programa está abierto, se solucionó esa aparente falla.
El menú de inicio lo puedes configurar como tú quieras, dejando la barra de tareas para eso, solo mostrar los programas que están abiertos.
Pantalla 1
Pantalla 2
Desde que instalé W11, decidí mantener limpio lo más posible el escritorio, en W10/W7 había enlaces directos por todos lados