Asi mirando por encima:
La asus puede llevar RAM 3466 vs 3200.
Asus pone que puede con 4xfire vs 2xfire msi.
Asus 4 puertos sata (pocos?) vs 6 puertos msi.
Ninguna de las dos acepta SLI, por si te lo planteas en un futuro.
Entiendo que si miras estas placas no eres un fanatico del overclock. Con la mia y un evo212 he podido subir el 6600k a 4,6 sin problemas con 1,34. La bios de MSI la verdad que me ha gustado mucho, y el acabdo de la placa tambien. Mira bien el tema de la conectividad via puertos sata, 4 me parece poco pero te podria valer.
Yo todavia no le he encontrado ninguna pega a la mia, tal vez el tema de mystyc light ahora que estaba mirando para poner unas leds, pero mirando gama de entrada sabia lo que habia.
De todas formas, a ver si entra alguien mas entendido que yo (temas de fases y demas) y alomejor por un poco mas puede recomendarte una placa mejor. Si pones lo que buscas en la placa tambien ayudara.