Vale.
Intenta poner
la tarjeta de RED en el segundo puerto PCiExpress x16,
y
una vez puesta vuelves a resetear el BIOS y prueba.
Si continúa igual, no creo que tengas problemas por esos reinicios,
aunque también puede que haya alguna actualización del BIOS para corregirlos.
También mira en BIOS >
Advanced >
Onboard Devices Configuration > a ver si hay algún parámetro de los distintos PCi a poder cambiar.
O en deshabilitar el Controlador LAN (provisionalmente) a ver que hace el BIOS.
En fin, es cuestión de ir probando, pero está claro que al detectar la tarjeta de RED WIFI, el BIOS se reconfigura.